Identifikasi Bakteri Asam Laktat Penghasil Bakteriosin dan Uji Aktivitas Antimikrobanya

Bakteri dapat diidentifikasi secara fenotip dan genotip. Identifikasi secarafenotip membutuhkan waktu yang lebih lama dibandingkan identifikasi secaragenotip. Identifikasi secara genotip dilakukan dengan analisis molekulermenggunakan gen 16S rRNA. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menentukangenus atau spesies bakteri asam laktat penghasil bakteriosin pada dadih, melakukanuji aktivitas antimikrobanya dan memperkirakan ukuran protein bakteriosin. Massamolekul bakteriosin diperkirakan dengan menggunakan elektroforesis SDS-PAGE.Identifikasi dilakukan dengan cara skrining dan isolasi bakteri asam laktat padadadih, kemudian mengisolasi DNA kromosom isolat bakteri yang telah diperoleh(UBC-DTK-02). DNA kromosom bakteri digunakan sebagai cetakan untukamplifikasi gen 16S rRNA dengan metode PCR. Amplikon PCR dielektroforesisdengan gel agarose dan dimurnikan untuk dilakukan sekuensing dengan metodeDideoxy-Sanger. Hasil sekuensing dianalisa menggunakan software BioEdit.Selanjutnya, urutan basa nukleotida gen 16S rRNA digunakan untuk identifikasispesies dengan menggunakan program BLASTn dan MEGA-X. Berdasarkanidentifikasi diketahui isolat bakteri asam laktat penghasil bakteriosin UBC-DTK02termasukspesiesEnterococcusfaecalis.UjiaktivitasantimikrobabakteriasamlaktatpenghasilbakteriosinUBC-DTK-02dilakukanpadabakteriEscherichiacolidanStaphylococcusaureusdenganmetodedifusicakram.TerbentukzonahambatbeningdisekitarkertascakrampadabakteriEscherichiacolidanStaphylococcusaureus.BakteriosinUBC-DTK-02yangdiperolehmerupakanbakteriosinkelasIII.