Deteksi Salmonella sp. pada Ayam Tiren Menggunakan Real Time Polymerase Chain Reaction (qPCR)

Salmonella sp. merupakan bakteri patogen penyebab utama penyakit bawaan pangan (foodborne disease) yang sering ditemukan pada produk daging ayam. Ayam tiren, yaitu ayam yang mati bukan karena disembelih, memiliki risiko tinggi terkontaminasi Salmonella akibat proses kematian dan penanganan yang tidak higienis. Tujuan penelitian ini adalah mengetahui hasil deteksi Salmonella sp. pada ayam tiren menggunakan metode Real-Time PCR (qPCR) berbasis SYBR Green. Penelitian dilakukan secara deskriptif pada 20 sampel daging ayam tiren yang diperoleh dengan cara memilih ayam yang mati dari peternakan ayam. Amplifikasi gen target dilakukan dengan primer spesifik Salmonella OY-F dan OY- R, dan hasil dianalisis berdasarkan nilai Cycle threshold (Ct) serta diverifikasi melalui elektroforesis gel agarosa. Hasil penelitian menunjukkan mayoritas sampel positif terdeteksi Salmonella sp., dengan nilai Ct bervariasi antara 14,20–39,22, yang mencerminkan perbedaan konsentrasi DNA bakteri pada masing-masing sampel. Temuan ini melanggar ketentuan SNI 7388:2009 yang menetapkan standar “negatif/25 g” untuk Salmonella, sehingga daging ayam tiren tidak layak dikonsumsi. Metode qPCR terbukti memberikan hasil deteksi yang cepat (<24 jam), akurat, dan sensitif, serta berpotensi digunakan sebagai metode pendukung pengawasan keamanan pangan di Indonesia.