Fadhilah, Hafizah
(2024)
Analisis Variasi Genetik Tumbuhan Endemik Gunung Pancar Jawa
Barat Peristrophe pantjarensis Hochr. dengan Teknik RAPD PCR.
Skripsi thesis, Universitas Negeri Padang.
Abstract
Peristrophe pantjarensis Hochr. adalah tanaman endemik dari Gunung
Pancar, Jawa Barat, dengan distribusi yang sangat terbatas. Tanaman endemik
dengan area sebaran yang sempit lebih rentan terhadap risiko kepunahan
dibandingkan dengan yang memiliki sebaran luas. Oleh karena itu, penting untuk
melakukan upaya konservasi guna melestarikan spesies ini. Teknik RAPD PCR
menjadi alternatif untuk mengatasi masalah tersebut. Informasi mengenai
keragaman genetik tanaman sangat penting untuk merancang strategi konservasi
dan pemuliaan tanaman yang berkelanjutan.
Tujuan penelitian ini yaitu untuk mengetahui profil genetik dan
menganalisis tingkat keragaman genetik P. pantjarensis menggunakan penanda
molekuler RAPD-PCR dengan metode touchdown PCR. DNA diisolasi dengan
QIAamp® DNA Mini Kit lalu diamplifikasi dengan 10 jenis primer RAPD. Produk
amplifikasi di elektroforesis dengan gel agarose 1,2% serta tegangan listrik 100
volt selama 40 menit. Skoring pita DNA dilakukan menggunakan aplikasi
molekuler Gel Analyzer dan secara manual. Analisis tingkat keragaman genetik
dilakukan menggunakan Jaccard similarity pada aplikasi PAST 4.16c.
Hasil penelitian menunjukan tingkat polimorfisme P. pantjarensis adalah
100%, tidak ada pita monomorfik yang terlihat. Nilai Jaccard similarity atau
distance indexes menunjukkan 9 sampel P. pantjarensis memiliki nilai variasi
genetik yang tinggi dan tingkat keragaman genetik yang tinggi dengan rentang nilai
koefisien asosiasi 0 - 0,21. Hasil dendrogram metode UPGMA terdapat 3 klaster,
menunjukkan bahwa setiap aksesi dalam suatu klaster tidak dipengaruhi oleh letak
geografis dan ketinggian tempat setiap aksesi
Actions (login required)
 |
View Item |
