Aulia, Ony Nattasha
(2024)
Desain Diagnostik Cepat Mycobacterium tuberculosis
yang Resisten Terhadap Isoniazid Berbasis Loop-Mediated Isothermal
Amplification (LAMP).
Skripsi thesis, Universitas Negeri Padang.
Abstract
Tuberkulosis (TB), yang disebabkan oleh Mycobacterium tuberculosis
(MTB), tetap menjadi salah satu penyebab utama kematian di Indonesia.
Keterbatasan alat diagnostik untuk TB, termasuk Tuberkulosis Resistensi Obat
(TB-MDR), turut berkontribusi pada peningkatan jumlah kasus. MDR-TB
merupakan bentuk TB yang resisten terhadap Obat Anti Tuberkulosis (OAT),
seperti Isoniazid (INH). Merespons hal ini, metode cepat tanpa peralatan yang
mahal seperti Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP) merupakan salah
satu metode deteksi MDR TB yang direkomendasikan WHO. Penelitian ini
bertujuan untuk merancang primer, menguji spesifisitas primer dan mengoptimasi
metode LAMP untuk mendeteksi M. tuberculosis yang resisten terhadap
Isoniazid.
Penelitian ini merupakan penelitian deskriptif dengan menggunakan
pendekatan bioinformatika untuk merancang primer LAMP. Desain primer
dilakukan menggunakan aplikasi PrimerExplorerV5. Optimasi metode LAMP
melibatkan parameter suhu dan waktu, dengan enam perlakuan suhu dan sepuluh
perlakuan waktu. Optimasi reaksi LAMP menggunakan genome M. tuberculosis
sebagai cetakan DNA
Penelitian ini berhasil mendesain tiga pasang primer untuk reaksi LAMP,
yaitu F3, B3, FIP, BIP, LF, dan LB. Suhu optimum untuk reaksi LAMP dalam
mendeteksi mutasi gen katG adalah 60°C, sementara untuk gen inhA adalah 65°C.
Waktu optimum reaksi LAMP untuk gen katG dan gen inhA adalah 50 menit.
Actions (login required)
 |
View Item |
