Putra, Ahadul (2018) Isolasi dan Sekuensing Gen 16S rRNA dari Genom Bakteri Pendegradasi Inulin pada Rizosfer Umbi Dahlia sp. Skripsi thesis, Universitas Negeri Padang.
|
Text
A_08_AHADUL_PUTRA_14036001_3202_2018.pdf Download (86kB) | Preview |
Abstract
Identifikasi bakteri dapat dilakukan secara genotip menggunakan gen 16S rRNA. Langkah awal identifikasi bakteri dengan cara mengisolasi DNA kromosom bakteri pendegradasi inulin dari rizosfer umbi Dahlia sp. DNA kromosom bakteri digunakan sebagai template untuk amplifikasi gen 16S rRNA menggunakan metode PCR. Amplikon yang dihasilkan dielektroforesis menggunakan gel agarosa. Pita gen 16S rRNA hasil elektroforesis dimurnikan menggunakan metode Gel/PCR fragment DNA extraction kit. Gen 16S rRNA dikloning menggunakan vektor pGEM-T Easy menghasilkan DNA rekombinan. DNA Rekombinan ditransformasikan ke dalam sel kompeten. Keberhasilan kloning dibuktikan dengan skrining koloni berwarna biru dan koloni berwarna putih. DNA rekombinan yang mengandung gen 16S rRNA diisolasi dan dimurnikan untuk disekuensing. Sekuensing gen 16S rRNA dilakukan menggunakan metode Dideoxy-Sanger. Hasil sekuensing dianalisa urutan basa nukleotida menggunakan software DNAStar. Urutan basa nukleotida gen 16S rRNA yang telah dianalisa terdiri dari 1501 bp (base pair). Urutan basa nukleotida gen 16S rRNA dapat digunakan untuk identifikasi bakteri menggunakan progran BLASTn dan MEGA. Berdasarkan identifikasi, bakteri pendegradasi inulin dari rizosfer umbi Dahlia sp. termasuk kelompok genus Klebsiella dan spesies Klebsiella pneumoniae.
| Item Type: | Thesis (Skripsi) |
|---|---|
| Subjects: | Q Science > QD Chemistry |
| Divisions: | Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Kimia - S1 |
| Depositing User: | Arlianis |
| Date Deposited: | 27 Jan 2020 06:55 |
| Last Modified: | 27 Jan 2020 06:55 |
| URI: | http://repository.unp.ac.id/id/eprint/24863 |
Actions (login required)
 |
View Item |
