https://repository.unp.ac.id/id/eprint/48006 2026-09-18T07:41:59Z info:eu-repo/semantics/descriptiveMetadata https://repository.unp.ac.id/id/eprint/48006/ Optimasi Teknik Isolasi DNA Genom Sederhana sebagai Dasar Pengembangan Metode Autentikasi Stok Kultur Bakteri Menggunakan Rapd Muthmainnah, Annisa Q Science (General) QH301 Biology Isolasi DNA genom bakteri merupakan tahapan penting dalam analisis molekuler, termasuk autentikasi stok kultur bakteri. Metode isolasi DNA yang umum digunakan sering kali memerlukan biaya tinggi dan prosedur yang kompleks. Oleh karena itu, diperlukan metode alternatif yang lebih sederhana dan ekonomis namun tetap fungsional. Penelitian ini bertujuan untuk mengoptimasi metode isolasi DNA genom bakteri berbasis boiling serta mengevaluasi sensitivitas dan aplikasinya sebagai sumber DNA cetakan untuk analisis PCR dan PCR-RAPD pada beberapa isolat bakteri. Penelitian ini merupakan penelitian deskriptif, dilakukan di Laboratorium Biologi menggunakan beberapa stok kultur bakteri dengan karakteristik suhu optimum berbeda. Optimasi dilakukan terhadap variasi suhu dan waktu boiling, konsentrasi buffer TE (1 dan 1/10), serta stabilitas DNA melalui uji freeze– thawing. Konsentrasi dan kemurnian DNA diukur menggunakan nanofotometer, kemudian kelayakan DNA sebagai cetakan diuji melalui PCR konvensional menggunakan primer 16S rRNA dan PCR-RAPD menggunakan primer OPA-02, OPA-04, dan OPE-15. Sensitivitas metode dianalisis berdasarkan pengenceran kultur bakteri mengacu pada standar McFarland. Hasil penelitian menunjukkan bahwa metode boiling dengan kondisi optimum mampu menghasilkan DNA genom dengan kualitas yang cukup baik dan dapat diamplifikasi melalui PCR dan PCR-RAPD. Buffer TE (1) memberikan stabilitas DNA yang lebih baik, dan metode ini tetap efektif meskipun kemurnian DNA tidak selalu mencapai standar ideal. Secara keseluruhan, metode yang dioptimasi bersifat sederhana, cepat, dan aplikatif, sehingga berpotensi digunakan sebagai dasar pengembangan metode autentikasi stok kultur bakteri di laboratorium dengan keterbatasan sumber daya. 0026-04 Thesis NonPeerReviewed text en https://repository.unp.ac.id/id/eprint/48006/1/final_4_Annisa_Muthmainnah_22032008_4934_2026.pdf Muthmainnah, Annisa (0026) Optimasi Teknik Isolasi DNA Genom Sederhana sebagai Dasar Pengembangan Metode Autentikasi Stok Kultur Bakteri Menggunakan Rapd. Bachelor/Skripsi thesis, Universitas Negeri padang. info:eu-repo/semantics/objectFile info:eu-repo/semantics/humanStartPage