Repository Universitas Negeri PadangDesain Primer dan Optimasi PCR Gen EDNRB Ekson 2 dan 3 untuk Analisis Mutasi Gen pada Hirschsprung DiseaseAnisaFitriauthorHirschsprung Disease (HD) adalah suatu gangguan pada perkembangan dari sistem saraf enterik yang mempunyai karakteristik tidak adanya sel ganglion di submukosa dan pada dinding saluran pencernaan. Gen reseptor endothelin type B (EDNRB) adalah gen kedua yang paling banyak mengalami mutasi setelah RET dalam HD. Gen EDNRB terletak pada kromosom 13q22. Gen ini memiliki panjang 24 kilobasa dan terdiri dari 7 ekson dan 6 intron. Gen EDNRB mengkode subtipe reseptor berpasangan protein G, yang memiliki peran penting untuk perkembangan neuron enterik dan melanosit epidermis. Untuk mendapatkan hasil PCR yang akurat, diperlukan desain primer yang tepat dan spesifik. Penelitian ini bertujuan melakukan desain primer dan menentukan kondisi PCR optimum untuk amplifikasi gen EDNRB pada ekson 2 dan 3. Jenis penelitian ini adalah deskriptif yaitu memberi gambaran atau deskripsi mengenai desain primer gen EDNRB ekson 2 dan 3 serta optimasi PCR. Penelitian dilakukan pada bulan Maret - Mei 2025 di Laboratorium Genetika dan Bioteknologi, Departemen Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Negeri Padang. Desain primer dilakukan dengan menggunakan program Geneious Prime. DNA diisolasi dari sampel darah manusia yang tidak terindikasi penyakit hirschsprung dan dilakukan optimasi suhu annealing serta optimasi konsentrasi primer. Penelitian ini berhasil mendesain sepasang primer dengan urutan nukleotida pada primer forward 5’-GGC TCA AGT TTG CTC TGA TG-3’ dan primer reverse 5’-GGA CCT GGT TTA TCT ATG CC-3’. Primer yang telah didesain memenuhi kriteria primer yang ideal, yaitu memiliki panjang basa 20 bp, %GC 50%, nilai melting temperature pada primer forward 57.1˚C dan pada primer reverse 55.3˚C dengan selisih Tm 1.8˚C, serta tidak memiliki Hairpin dan self-dimer. Berdasarkan uji spesifisitas secara in silico diketahui primer secara spesifik mengamplifikasi ekson 2 dan ekson 3 gen EDNRB dengan menghasilkan amplikon 966 bp. Suhu annealing yang optimum adalah 55,3˚C. Konsentrasi primer yang optimum adalah 1,1 μM.QH301 Biology2025Universitas Negeri Padang;Biologi FMIPA UNPThesis

For work being deposited by its own author: In self-archiving this collection of files and associated bibliographic metadata, I grant Repository Universitas Negeri Padang the right to store them and to make them permanently available publicly for free on-line. I declare that this material is my own intellectual property and I understand that Repository Universitas Negeri Padang does not assume any responsibility if there is any breach of copyright in distributing these files or metadata. (All authors are urged to prominently assert their copyright on the title page of their work.)

For work being deposited by someone other than its author: I hereby declare that the collection of files and associated bibliographic metadata that I am archiving at Repository Universitas Negeri Padang is in the public domain. If this is not the case, I accept full responsibility for any breach of copyright that distributing these files or metadata may entail.

Clicking on the Deposit Item Now button indicates your agreement to these terms.