TY  - THES
A1  - Rahmi, Angelika
ID  - repounp46111
M1  - Skripsi
KW  - DESAIN DAN OPTIMASI PRIMER Mmp8
N2  - Matrix Metalloproteinase-8 (Mmp8) merupakan enzim proteolitik yang berperan penting dalam proses degradasi matriks ekstraseluler serta regulasi respon inflamasi pada jaringan tubuh, termasuk hati. Ekspresi Mmp8 diketahui meningkat pada kondisi stres oksidatif dan inflamasi yang dipicu oleh hipoksia intermiten, yaitu keadaan kekurangan oksigen yang terjadi secara berulang dan fluktuatif. Kondisi hipoksia intermiten dapat memicu peningkatan mediator inflamasi dan enzim proteolitik seperti Mmp8, sehingga memperburuk kerusakan jaringan hati. Penelitian ini berfokus pada desain dan optimasi primer gen Mmp8 pada Rattus norvegicus sebagai langkah awal alat molekuler yang valid untuk mendeteksi perubahan ekspresi Mmp8 sebagai marker inflamasi pada jaringan hati tikus yang mengalami hipoksia intermiten. Jenis penelitian ini adalah penelitian deskriptif dengan pendekatan kuantitatif. Mengenai desain primer gen Mmp8 serta optimasi suhu annealing qRT-PCR. Desain primer dilakukan menggunakan perangkat lunak Geneious Prime, dengan memanfaatkan sekuen gen Matrix Metalloproteinase-8 (Mmp8) yang memiliki nomor akses NM_022221.2, diperoleh dari basis data NCBI (National Center for Biotechnology Information) dalam format GenBank. Selanjutnya, primer yang telah memenuhi kriteria tersebut diuji spesifisitasnya secara in silico menggunakan Primer-BLAST yang tersedia di situs NCBI. Berdasarkan hasil analisis, primer forward memiliki urutan nukleotida CGGGGTATTGGAGGAGATGC dengan panjang 20 basa, kandungan GC sebesar 60%, dan suhu leleh (Tm) 59,96°C, sedangkan primer reverse memiliki urutan CAGGGTGTGCTGAAGGTCCATA dengan panjang 22 basa. Hasil elektroforesis memperlihatkan bahwa pita DNA dengan ukuran sekitar 241 bp muncul jelas pada suhu annealing 57,7°C dan 56,1°C, yang menunjukkan keberhasilan amplifikasi fragmen target gen Mmp8 sesuai ukuran yang telah diprediksi dari hasil desain primer in silico.
PB  - Universitas Negeri Padang
AV  - public
TI  - Desain dan Optimasi Primer Mmp8 untuk Analisis Inflamasi pada Jaringan Hati Tikus (Rattus novergicus) Hypoxia Intermittent
Y1  - 2025///
UR  - https://repository.unp.ac.id/id/eprint/46111/
ER  -