Repository Universitas Negeri PadangDesain dan Optimasi Primer Mmp8 untuk Analisis Inflamasi pada Jaringan Hati Tikus (Rattus novergicus) Hypoxia IntermittentAngelikaRahmiauthorMatrix Metalloproteinase-8 (Mmp8) merupakan enzim proteolitik yang berperan penting dalam proses degradasi matriks ekstraseluler serta regulasi respon inflamasi pada jaringan tubuh, termasuk hati. Ekspresi Mmp8 diketahui meningkat pada kondisi stres oksidatif dan inflamasi yang dipicu oleh hipoksia intermiten, yaitu keadaan kekurangan oksigen yang terjadi secara berulang dan fluktuatif. Kondisi hipoksia intermiten dapat memicu peningkatan mediator inflamasi dan enzim proteolitik seperti Mmp8, sehingga memperburuk kerusakan jaringan hati. Penelitian ini berfokus pada desain dan optimasi primer gen Mmp8 pada Rattus norvegicus sebagai langkah awal alat molekuler yang valid untuk mendeteksi perubahan ekspresi Mmp8 sebagai marker inflamasi pada jaringan hati tikus yang mengalami hipoksia intermiten. Jenis penelitian ini adalah penelitian deskriptif dengan pendekatan kuantitatif. Mengenai desain primer gen Mmp8 serta optimasi suhu annealing qRT-PCR. Desain primer dilakukan menggunakan perangkat lunak Geneious Prime, dengan memanfaatkan sekuen gen Matrix Metalloproteinase-8 (Mmp8) yang memiliki nomor akses NM_022221.2, diperoleh dari basis data NCBI (National Center for Biotechnology Information) dalam format GenBank. Selanjutnya, primer yang telah memenuhi kriteria tersebut diuji spesifisitasnya secara in silico menggunakan Primer-BLAST yang tersedia di situs NCBI. Berdasarkan hasil analisis, primer forward memiliki urutan nukleotida CGGGGTATTGGAGGAGATGC dengan panjang 20 basa, kandungan GC sebesar 60%, dan suhu leleh (Tm) 59,96°C, sedangkan primer reverse memiliki urutan CAGGGTGTGCTGAAGGTCCATA dengan panjang 22 basa. Hasil elektroforesis memperlihatkan bahwa pita DNA dengan ukuran sekitar 241 bp muncul jelas pada suhu annealing 57,7°C dan 56,1°C, yang menunjukkan keberhasilan amplifikasi fragmen target gen Mmp8 sesuai ukuran yang telah diprediksi dari hasil desain primer in silico.QH301 Biology2025Universitas Negeri Padang;Biologi FMIPA UNPThesis

For work being deposited by its own author: In self-archiving this collection of files and associated bibliographic metadata, I grant Repository Universitas Negeri Padang the right to store them and to make them permanently available publicly for free on-line. I declare that this material is my own intellectual property and I understand that Repository Universitas Negeri Padang does not assume any responsibility if there is any breach of copyright in distributing these files or metadata. (All authors are urged to prominently assert their copyright on the title page of their work.)

For work being deposited by someone other than its author: I hereby declare that the collection of files and associated bibliographic metadata that I am archiving at Repository Universitas Negeri Padang is in the public domain. If this is not the case, I accept full responsibility for any breach of copyright that distributing these files or metadata may entail.

Clicking on the Deposit Item Now button indicates your agreement to these terms.