Putri, Aisyah Fadillah
(2024)
Studi Filogenetik Genus Kalophrynus di Sumatera Barat
Berdasarkan Gen 16S rRNA.
Skripsi thesis, Fakultas Matematika & Ilmu Pengetahuan Alam.
Abstract
Genus Kalophrynus (Anura: Microhylidae) telah diperkenalkan dan
dideskripsikan. Semua anggota dari genus ini tersebar mulai dari Cina bagian
selatan dan timur laut India sampai ke Indo-China dan Indo-Malaya. Penelitian ini
bertujuan untuk mengetahui hubungan kekerabatan dari spesies Kalophrynus
di Sumatera Barat dengan menggunakan gen 16S rRNA.
DNA diambil dari jaringan hati spesimen Kalophrynus di ekstraksi
menggunakan KIT Qiagen DNeasy Blood & tissue dan gen 16S rRNA
diamplifikasi menggunakan pasangan primer 16Sc-L(5’GTRGGCCTA
AAAGCAGCCAC-3’) dan 16Sd-H(5’CTCCGGTCTGAACTCAGATGACGT
AG -3’). Hasil sekuens dianalisis menggunakan DNA Baser Assembler.
Identifikasi sekuens dilakukan dengan metode BLAST (Basic Local Alignment
Tools). Analisis filogenetik dilakukan dengan menggunakan MEGA 11, dengan
metode Maximum Likelihood. Untuk analisis jarak genetik setiap sekuen
dilakukan menggunakan metode pairwisedistance.
Hasil penelitian menunjukkan bahwa Kalophrynus yang dikoleksi langsung
dari Lembah Anai, Sumatera Barat (UNP 214, 215 dan 240) memiliki kekerabatan
yang dekat dengan K. meizon dengan nilai jarak genetik 53,1%, 54,1% dan
54,2% .
Actions (login required)
 |
View Item |
