Vaniana, Dina
(2019)
Desain Primer untuk Sekuensing yang akan Mengenali Daerah Internal Gen 16S rRNA Bakteri Endofit Penghasil Senyawa Antimikroba.
Skripsi thesis, Universitas Negeri Padang.
Abstract
Kemampuan bakteri endofit berinteraksi dengan inang dan dapat
menghasilkan senyawa aktif membuat bakteri ini bermanfaat bagi lingkungannya.
Senyawa aktif bakteri endofit memiliki kemampuan sebagai antikanker,
antimikroba dan antioksidan. Terdapat gen 16S rRNA pada setiap jenis bakteri.
Proses sekuensing merupakan metode yang baik digunakan untuk
mengidentifikasi bakteri. Tujuan penelitian ini adalah untuk mendesain primer
untuk proses sekuensing yang akan mengenali daerah gen 16S rRNA bakteri
endofit penghasil senyawa antimikroba.
Penelitian ini merupakan penelitian deskriptif. Penelitian ini dilaksanakan
dari bulan Oktober sampai bulan Desember 2018 di Laboratorium Penelitian
Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Negeri Padang.
Pengambilan sekuen dilakukan melalui website National Center for
Biotechnology Information (NCBI). Uji bioinformatika yang dilakukan
menggunakan software BioEdit dan Primer Designer. Isolat yang digunakan
sebagai cetakan DNA adalah B.J.T.A.2.1. Primer yang telah didesain dianalisis di
Macrogen Singapura dan dilakukan proses sekuensing.
Hasil penelitian menunjukkan bahwa primer yang didesain mampu
digunakan untuk proses sekuensing yaitu primer NIF (forward) dan primer NIR
(reverse). Proses sekuensing mampu menghasilkan sekuen yang utuh meskipun
hanya ±100 bp yang dapat dibaca dengan baik.
Actions (login required)
 |
View Item |
