Albar, Rahmat
(2023)
Kajian Keragaman Genetik Nepenthe spp. Koleksi Kebun Raya Cibodas dengan Marka ISSR.
Skripsi thesis, Fakultas Matematika & Ilmu Pengetahuan Alam.
Abstract
Nepenthes spp. merupakan tumbuhan yang memiliki keunikan dan kekhasan dari morfologinya yang memiliki bentuk seperti kantong. Perkembangan kondisi status Nepenthes spp. semakin menurun akibat faktor perburuan yang membuat status
beberapa species Nepenthes spp. terancam punah. Oleh sebab itu, perlu upaya konservasi untuk mempertahankan jenis tumbuhan ini. Salah satu upaya dalam konservasi adalah dengan mempelajari tumbuhan secara genetik seperti
menganalisis keragaman species Nepenthes spp. Kebun Raya Cibodas memiliki beberapa koleksi species Nepenthes spp. yang sedang dilindungi. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui primer yang paling optimum dari primer ISSR yang mengkarakteristik keragaman genetik Nepenthes spp. koleksi
Kebun Raya Cibodas dan mengetahui tingkat variasi genetik tumbuhan Nepenthes spp. Metode ekstraksi DNA berbasis CTAB yang dimodifikasi dengan penggunaan RNAse serta optimasi suhu annealing (Ta) 11 primer ISSR menghasilkan proses
amplifikasi DNA tumbuhan Nepenthes spp. yang baik. Produk PCR yang telah diVisualisasi kan pada gel agarose selanjutnya diterjemahkan ke dalam data biner dan dianalisis indeks keragamannya melalui program NTSys sehingga diperoleh
dendogram kekerabatan. Hasil penelitian menunjukkan bahwa optimasi suhu annealing 11 primer ISSR rata-rata berkisar 50˚C ke atas dengan siklus 40x. Semua Pita DNA yang
teramplifikasi oleh 11 primer ISSR berada pada panjang kisaran 100-1100 bp. Dendogram kekerabatan yang terbentuk dari terjemahan data biner DNA Nepenthes spp. membentuk 3 klaster utama yaitu klaster 1 terdiri dari N. ventricosa Blanco, N. adrianii x clipeata, N. spathulata Danser, N. maxima Reinw, ex Nees, N. mirabilis (Lour.) Druce., N. tobaica Danser dan N. truncata Macfarl. Klaster 2 adalah species N. gymnamphora dan klaster 3 dari species Nepenthes sp
Actions (login required)
 |
View Item |
