Hafsah, Jumatul
(2022)
Ekspresi Gen Monodehydroascorbate Reductase (MDHAR) Akar Beberapa Varietas Padi (Oryza Sativa L.) yang Mendapat Perlakuan Simulasi Kekeringan Menggunakan PEG.
Skripsi thesis, Universitas Negeri Padang.
Abstract
Pada kondisi kekeringan gen tertentu akan diinduksi sebagai bentuk pertahanan tumbuhan. Produk dari gen tersebut akan terlibat dalam perlindungan seluler dari kerusakan terkait stres. Adaptasi terhadap cekaman kekeringan pada tanaman melibatkan perubahan ekspresi gen sebagai respon terhadap kekeringan. Gen Monodehydroascorbate reductase (MDHAR) bertanggung jawab atas pertumbuhan, perkembangan dan respon cekaman pada tanaman. Penelitian ini bertujuan untuk merancang primer dan mengetahui optimasi suhu annealing primer serta mengetahui ekspresi gen MDHAR akar beberapa varietas padi dipengaruhi oleh tingkat ketahanan setiap varietas padi yang mendapat perlakuan simulasi kekeringan menggunakan PEG. Penelitian yang dilakukan merupakan penelitian eksperimen. Penelitian ini menggunakan Rancangan Acak Lengkap (RAL) dengan 1 faktor dan 3 kali ulangan. Faktor tersebut adalah tiga varietas padi yaitu varietas Harum (toleran), Situbagendit (moderat), dan Rosna (sensitif). Metode yang digunakan dalam penelitian ini yaitu desain primer, optimasi suhu annealing primer dan uji ekspresi gen. Untuk uji ekspresi gen MDHAR dimulai dari isolasi RNA, sintesis cDNA, dan Reverse Transciption Polymerase Chain Reaction (RT-PCR). Ekspresi gen MDHAR diukur secara semi kuantitatif RT-PCR yang dinyatakan dalam ketebalan pita.
Hasil desain primer MDHAR diperoleh primer ideal dengan urutan forward 5’-AAAAACACTGCATGGGTCGTC-3’ dan reverse 5’- CGCCTACCGTTTCCCAAGTT-3’. Pasangan primer dapat mengamplifikasi gen MDHAR dari Oryza sativa dengan ukuran produk 160 bp. Hasil optimasi suhu annealing optimum untuk pasangan primer tersebut adalah suhu 60 °C. Varietas toleran dan sensitif mengalami penurunan ekspresi gen, sedangkan varietas moderat mengalami peningkatan ekspresi gen.
Actions (login required)
 |
View Item |
